Q. 外部ファイルを参照して、それぞれの出力に反映させることはできますか？

A. はい、できます。

PDFの可変印刷（バリアブル印刷）でできます。
可変印刷（バリアブル印刷）について詳しくは、1つ1つの印刷物に、異なった情報を入れて印刷したいをごらんください。